Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CCL5P13501 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CCL5P13501 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCL5P13501 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL5P13501 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL5P13501 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCL5P13501 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCL5P13501 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL5P13501 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL5P13501 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL5P13501 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CCL5P13501 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL5P13501 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL5P13501 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL5P13501 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCL5P13501 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCL5P13501 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCL5P13501 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL5P13501 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL5P13501 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL5P13501 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL5P13501 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCL5P13501 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCL5P13501 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL5P13501 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL5P13501 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCL5P13501 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCL5P13501 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms