Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF5P13349 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MYF5P13349 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MYF5P13349 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MYF5P13349 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MYF5P13349 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MYF5P13349 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MYF5P13349 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF5P13349 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF5P13349 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF5P13349 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MYF5P13349 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MYF5P13349 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF5P13349 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MYF5P13349 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms