Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SPP1P10451 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SPP1P10451 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPP1P10451 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPP1P10451 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SPP1P10451 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SPP1P10451 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SPP1P10451 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SPP1P10451 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SPP1P10451 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms