Protein–RNA interactions for Protein: P0DP23

CALM1, Calmodulin-1, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM1P0DP23 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CALM1P0DP23 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CALM1P0DP23 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CALM1P0DP23 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms