Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C1RP00736 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
C1RP00736 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1RP00736 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C1RP00736 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
C1RP00736 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C1RP00736 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C1RP00736 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1RP00736 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C1RP00736 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
C1RP00736 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C1RP00736 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1RP00736 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1RP00736 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1RP00736 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1RP00736 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C1RP00736 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
C1RP00736 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
C1RP00736 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
C1RP00736 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
C1RP00736 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
C1RP00736 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms