Protein–RNA interactions for Protein: O95248

SBF1, Myotubularin-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBF1O95248 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SBF1O95248 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SBF1O95248 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SBF1O95248 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SBF1O95248 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SBF1O95248 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SBF1O95248 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SBF1O95248 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBF1O95248 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBF1O95248 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SBF1O95248 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SBF1O95248 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBF1O95248 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBF1O95248 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBF1O95248 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBF1O95248 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SBF1O95248 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBF1O95248 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBF1O95248 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SBF1O95248 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SBF1O95248 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SBF1O95248 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBF1O95248 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SBF1O95248 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms