Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
CNTN5O94779 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTN5O94779 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN5O94779 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms