Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SURF6O75683 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SURF6O75683 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SURF6O75683 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SURF6O75683 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SURF6O75683 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SURF6O75683 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF6O75683 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF6O75683 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF6O75683 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF6O75683 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SURF6O75683 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SURF6O75683 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SURF6O75683 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SURF6O75683 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SURF6O75683 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SURF6O75683 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SURF6O75683 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SURF6O75683 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF6O75683 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SURF6O75683 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF6O75683 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SURF6O75683 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SURF6O75683 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SURF6O75683 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms