Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GCATO75600 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GCATO75600 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCATO75600 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCATO75600 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GCATO75600 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GCATO75600 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GCATO75600 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GCATO75600 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GCATO75600 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GCATO75600 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GCATO75600 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GCATO75600 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCATO75600 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GCATO75600 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms