Protein–RNA interactions for Protein: O60826

CCDC22, Coiled-coil domain-containing protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC22O60826 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC22O60826 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CCDC22O60826 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CCDC22O60826 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms