Protein–RNA interactions for Protein: O60393

NOBOX, Homeobox protein NOBOX, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOBOXO60393 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NOBOXO60393 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NOBOXO60393 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NOBOXO60393 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms