Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SRGAP3O43295 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SRGAP3O43295 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SRGAP3O43295 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms