Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GPAA1O43292 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GPAA1O43292 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
GPAA1O43292 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms