Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA3EO15041 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA3EO15041 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA3EO15041 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SEMA3EO15041 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA3EO15041 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms