Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
PTPRTO14522 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PTPRTO14522 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PTPRTO14522 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PTPRTO14522 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.57■■■□□ 2.96
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