Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
SOBPA7XYQ1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
SOBPA7XYQ1 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOBPA7XYQ1 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
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