Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
A0A0J9YYE9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
A0A0J9YYE9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
A0A0J9YYE9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms