Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRBV2A0A0J9YWF9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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