Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL11Q9NVR0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL11Q9NVR0 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms