Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NUP58Q9BVL2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms