Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 SESN3-203ENST00000536441 9558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 MKNK1-201ENST00000341183 2612 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 C9orf47-203ENST00000375851 4837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ACACA-237ENST00000616317 9961 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 POMT1-203ENST00000372228 3123 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 RSBN1L-201ENST00000334955 6422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 MAP2-201ENST00000199940 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 ZNF124-202ENST00000472531 2243 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01545Q5VT33 AC104758.3-203ENST00000562938 2123 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
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LINC01545Q5VT33 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
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