Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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RAB6CQ53S08 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAB6CQ53S08 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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