Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 EXOC6B-201ENST00000272427 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SGSM1-206ENST00000610372 5991 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CAD-202ENST00000403525 6900 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
IMPG1Q17R60 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms