Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDO1Q16878 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDO1Q16878 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDO1Q16878 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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