Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLC18A3Q16572 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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