Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 PPARGC1B-202ENST00000360453 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PGGHG-204ENST00000409655 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TNFRSF21-201ENST00000296861 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SAMD14-202ENST00000330175 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 DCDC2-202ENST00000378454 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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NEDD8Q15843 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
NEDD8Q15843 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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