Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RFTN1Q14699 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RFTN1Q14699 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms