Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CALD1Q05682 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CALD1Q05682 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms