Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HOXA13P31271 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms