Protein–RNA interactions for Protein: P19634

SLC9A1, Sodium/hydrogen exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A1P19634 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC9A1P19634 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms