Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VTNP04004 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VTNP04004 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VTNP04004 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms