Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 WNT5B-206ENST00000542408 508 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 LINC02347-203ENST00000540774 1442 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 COG6-212ENST00000630730 186 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DUX4L33-201ENST00000635217 958 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HIGD2B-201ENST00000311755 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 Metazoa_SRP.8-201ENST00000398067 251 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TMEM154-202ENST00000504064 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC022784.6-202ENST00000523246 674 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 THEG-204ENST00000530711 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZNF268-208ENST00000539248 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ZNF268-212ENST00000542711 861 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 FAHD2B-201ENST00000272610 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 KRTAP10-12-201ENST00000400365 873 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 Z69733.1-201ENST00000445990 632 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC025419.1-201ENST00000537250 690 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AL049840.2-201ENST00000602722 535 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 BX510359.7-201ENST00000619819 630 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ABCC9O60706 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 TAC4-203ENST00000352793 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 S100A7A-202ENST00000368728 440 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ABCC9O60706 ZNF32-AS2-201ENST00000418966 905 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms