Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SETD1B-204ENST00000619791 5901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GATAD2A-203ENST00000404158 5776 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
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ARL2-SNX15V9GYD0 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 ATG3-202ENST00000402314 3010 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 C10orf105-202ENST00000441508 4836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ARL2-SNX15V9GYD0 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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