Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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LHX3Q9UBR4 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
LHX3Q9UBR4 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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