Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TNK2-202ENST00000381916 4223 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SIPA1L3-201ENST00000222345 7987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4Q9P0V3 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms