Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYP9

KRTAP9-9, Keratin-associated protein 9-9, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-9Q9BYP9 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 BEST3-203ENST00000331471 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CAMK2D-214ENST00000515496 1533 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AP000473.2-201ENST00000602659 1537 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC110769.2-201ENST00000602760 1548 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 EEF1A1P14-201ENST00000421195 1376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SUCLA2P3-201ENST00000458157 1357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 DAP3-202ENST00000368336 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 IL1A-201ENST00000263339 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TRNAU1AP-201ENST00000373830 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TRIM51-202ENST00000449290 1629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PEX11B-203ENST00000537888 1632 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SLN-201ENST00000305991 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 IQCF2-201ENST00000333127 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01946-201ENST00000416279 418 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL935212.2-201ENST00000419207 718 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC005076.1-201ENST00000433446 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 NPC2-202ENST00000434013 875 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL389889.1-201ENST00000443747 566 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC234771.3-201ENST00000454984 622 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 OR7E163P-201ENST00000505943 894 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CRHBP-203ENST00000506501 912 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC094104.1-201ENST00000515822 584 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC008676.1-202ENST00000520658 545 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SLN-203ENST00000531293 906 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC124312.3-201ENST00000567527 1236 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RPS7P1-201ENST00000571702 585 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC007923.3-201ENST00000578645 292 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC021506.1-201ENST00000581971 597 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC011442.1-201ENST00000587831 366 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 RIT2-203ENST00000590910 870 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 SMIM17-202ENST00000600547 573 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AC010998.3-201ENST00000613871 631 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 ST7-OT4_3.1-201ENST00000615542 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
KRTAP9-9Q9BYP9 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms