Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IGHV5-51-201ENST00000390626 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HERVK_113Q902F9 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms