Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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GEN1Q17RS7 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
GEN1Q17RS7 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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