Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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PTPRNQ16849 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTPRNQ16849 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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