Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CES3-201ENST00000303334 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CES3-202ENST00000394037 3817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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TRIM25Q14258 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 PRRT3-203ENST00000412055 3761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
TRIM25Q14258 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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