Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALCAMQ13740 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALCAMQ13740 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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