Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FKBP11-202ENST00000444214 630 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMARCB1Q12824 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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