Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 RPL4P6-201ENST00000438116 1304 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00449-201ENST00000366259 872 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SPTLC1P3-201ENST00000403408 259 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC02507-201ENST00000509370 1028 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC022966.2-201ENST00000587434 367 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RORA-AS1-202ENST00000558140 869 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 TGM1-202ENST00000544573 1581 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC131011.1-201ENST00000366134 672 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 HNF1A-AS1-201ENST00000433033 612 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
CENPEQ02224 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RN7SL340P-201ENST00000470792 296 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.83-201ENST00000611762 320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.37-201ENST00000617743 320 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms