Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ECHS1P30084 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NR4A2-209ENST00000426264 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 ZNF202-207ENST00000530393 3564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ECHS1P30084 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 APOF-201ENST00000398189 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ECHS1P30084 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms