Protein–RNA interactions for Protein: P11441

UBL4A, Ubiquitin-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4AP11441 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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UBL4AP11441 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
UBL4AP11441 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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