Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TTC7A-202ENST00000394850 4306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PPFIA3O75145 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms