Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 COPS7B-201ENST00000350033 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SLC4A2-201ENST00000392826 3947 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 AC099521.2-201ENST00000619354 2036 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
TBCCD1Q9NVR7 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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