Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AL591471.1-201ENST00000621855 229 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SUSD3Q96L08 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms