Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RPAP2Q8IXW5 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPAP2Q8IXW5 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms