Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXB2

CXCL17, C-X-C motif chemokine 17, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL17Q6UXB2 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CXCL17Q6UXB2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CXCL17Q6UXB2 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms